原作ライトノベルは中高生を中心に絶大な人気を誇り、テレビアニメも大好評の「灼眼のシャナ」。初映画化となる本作では、原作小説の第1巻を基に、主人公の悠二と少女シャナとの出会いや、異世界から来た化け物・紅世の徒との戦いの始まりを描く。高校生の悠二は、人の“存在”を灯りに変えて喰らう化け物・紅世の徒に襲われたところを、紅蓮の髪と眼を持つ謎の少女に救われる。しかし彼は、自分がすでに“存在”していないことを知らされ……。

高中生-阪井悠二在新学期开始前，一直过着平凡的日子。不过有一天，原本平凡的日子突然起了变化?井悠二被一个会把人变成火焰之光，并将这火焰吸入体内的神秘男子亚格尼所袭击，破坏了他原本平静的生活。不过就在