这是一段攻壳机动队成立前夕鲜为人知而又影响深远的故事。2027年6月6日的一天，隶属陆军机密部队501机关的真室中佐（宫内敦士 配音）在闹市街头被人杀害，此前他曾陷入军火买卖的贿赂丑闻不得脱身，他对死

女主角津崎青叶是个美丽开朗的女孩，在奶奶去世后的一天突然被神秘人士绑架，带到了南美洲委内瑞拉的一个叫做安贝尔的组织里，并成为了一种叫做人机的巨型作战兵器的驾驶员。与她成为好友的黄坂蕾也成为另一人机的驾